Glossaire

  • ADN chloroplastique

    constituant le génome des chloroplastes, transmis uniquement par les mères, très peu variable dans le temps, permet de suivre les lignées maternelles

  • ADN mitochondrial

    constituant le génome des mitochondries : transmis uniquement par les mères, très peu variable dans le temps, permet de suivre les lignées maternelles

  • Apoptose

    capacité d'induire une mort cellulaire programmée

  • Barrière hémo-méningée

    (BHM) : "barrière de séparation" entre le sang périphérique et le système nerveux central

  • Cellule endothéliale

    cellule spécialisée qui fait partie de la composition des vaisseaux sanguins

  • Cellules NK

    catégorie de cellules de l'immunité à fonction cytotoxique

  • Chloroplastes

    compartiments cellulaires chez les végétaux, chargés de la photosynthèse. Transmis uniquement par la mère.

  • Cytoadhérence

    capacité d'adhérer aux cellules, en particulier aux cellules endothéliales

  • Epitope

    fragment de protéine immunogène

  • Etude phylogénique

    étude de l'évolution génétique d'un être vivant (micro-organisme, végétal, animal)

  • Hépatocyte

    cellule spécialisée du foie

  • Hépatome

    cellule maligne issue du tissu hépatique

  • Isolat

    une souche de parasite qui a été isolé du terrain

  • Lits microvasculaires profonds

    les petits vaisseaux situés dans les tissus profonds et notamment le cerveau

  • Mitochondries

    compartiments cellulaires chez les animaux, chargés de la synthèse énergétique. Transmis uniquement par la mère.

  • Pathogénicité

    capacité à induire une pathologie

  • PBMC

    (Peripheral Blood Mononuclear Cell) cellules mononucléées du sang périphérique

  • Phénotypique

    lié à la structure

  • Phylogéographie

    analyse phylogénique prenant aussi en compte la répartition géographique des lignées étudiées

  • Primatologie

    étude des espèces de l’ordre des primates

  • Primatologue

    personne spécialisée dans la science des primates.

  • Réponse CTL

    réponse immunitaire à fonction cytotoxique

  • Réservoir

    espèce animale qui héberge pendant une longue période un agent pathogène

  • Trypanosomose

    maladie du sommeil

  • Chloroplast DNA

    constitutes the chloroplast genome: transmitted only by mothers, very little variation over time, makes it possible to track maternal lineages

  • Mitochondrial DNA

    constitutes the mitochondrial genome: transmitted only by mothers, very little variation over time, makes it possible to track maternal lineages

  • Apoptosis

    ability to induce programmed cell death

  • Blood-brain barrier Barrier (BBB)

    barrier between the peripheral blood and central nervous system

  • Endothelial cell

    specialized cell that is part of the composition of blood vessels

  • NK cells

    class of immune cells with a cytotoxic function

  • Chloroplasts

    cellular compartments in plants responsible for photosynthesis. Transmitted only by mothers.

  • Cytoadherence

    ability to adhere to cells, particularly endothelial cells

  • Epitope

    immunogenic protein fragment

  • Phylogenetic Study

    Development study of the genetic evolution of a living being (micro-organism, plant, animal)

  • Hepatocyte

    specialized liver cells

  • Hepatoma

    malignant liver tissue cell

  • Isolate

    a parasite strain isolated from the field

  • Deep microvascular beds

    small blood vessels in the deep tissues, in particular the brain

  • Mitochondria

    cellular structures in animals, responsible for energy synthesis. Transmitted only by mothers.

  • Pathogenicity

    ability to induce disease

  • PBMC

    peripheral blood mononuclear cells

  • Phenotypic

    related to the structure

  • Phylogeography

    analysis that also takes into account the geographical distribution of the lines studied

  • Primatology

    study of the species of the order of primates

  • Primatologist

    someone who specializes in the science of primates.

  • CTL response

    cytotoxic immune response

  • Reservoir

    animal species that hosts a pathogen over a long period

  • Trypanosomiasis

    sleeping sickness

Unité de Recherche en Ecologie de la Santé (URES)

OBJECTIFS

L’URES développe une approche systémique des maladies infectieuses zoonotiques pour une meilleure compréhension des mécanismes d’émergence (transmission, franchissement des barrières d’espèces), de maintien et de diffusion des agents pathogènes au sein de peuplements et d’environnements changeants (endémisation). La finalité de cette approche étant l’amélioration des outils nécessaires à l’optimisation de la veille et de la prévention des émergences ou réémergence d’agents pathogènes.

 

EQUIPE

Chef d’unité : Jean-Paul Gonzalez

L’URES a été créée au CIRMF en 2009. Elle regroupe autour de thématiques innovantes et transversales des chercheurs travaillant dans les domaines des sciences de la santé (microbiologie, pathologie, géographie de la santé) et des sciences biologiques (écologie, biologie & génétique des populations), pour une approche multidisciplinaire de la recherche en Ecologie de la Santé.  


L’URES est composée de quatre équipes

1. Ecologie des réservoirs (responsable Dr. Mathieu Bourgarel).

2. Ecologie des systèmes vectoriels (resp. Dr. Christophe Paupy).

3. Primatologie et Santé (avec le Centre de Primatologie).

4. Cumul et combinaison des pathologies (Resp. J.-P. Gonzalez)


Equipe URES 2010 :

- Chercheurs : M. Bourgarel, J.-P. Gonzalez, C. Paupy, J. Mavoungou, G. Moussavou

- Volontaire International MAEE: P. Motsch

- Post doc : G.R. Ndong-Atome

- Agents techniques : P. Yangari, D. Ndzegho, A.

MOYENS

- laboratoire de biologie générale et moléculaire

- laboratoire d’entomologie médicale ;

- insectarium

- deux stations scientifiques permettant d’accueillir des projets de recherche structurants sur des thématiques en lien avec l’Ecologie de la santé (changements climatiques, biodiversité, éthologie, dynamique des populations, biodiversité) :

  • La  station d’Etude des Gorilles et des Chimpanzés (SEGC) dans le Parc national de la Lopé
  •  L’observatoire de santé de Dienga.

PRINCIPAUX AXES DE RECHERCHE

1. Biodiversité et conditions d’émergence des agents pathogènes d’origine zoonotiques.

2. Dynamiques forestières et changements environnementaux.

3. Cycle naturel des arbovirus.
4. Médecine de la conservation.

ACTIVITES DE RECHERCHE

1. Ecologie des hôtes naturels des filovirus (Ebola et Marburg) : ce projet vise à comprendre les mécanismes qui régissent les relations et les contacts entre les hôtes sensibles (Homme et grands singes) et les espèces réservoirs (chauves souris) et d’identifier les changements environnementaux qui favorisent la transmission, l’émergence/réémergence et la diffusion des filovirus.


2. Santé des primates : ce projet est une collaboration entre URES et différentes unités du CIRMF : Rétrovirologie, Maladies Emergentes et le CDP.  Des études sur des virus comme le SIV sont actuellement conduites sur les primates en captivité au CDP et les animaux sauvages dans le PN de la Lopé.

 

3. Etude du cercopithèque à queue de soleil : le projet développe les connaissances fondamentales sur cette espèce endémique au Gabon et fourni des outils indispensables à sa conservation. L’aspect innovant de ce projet s’illustre par son approche multidisciplinaire qui fait appel à la primatologie (biologie, éthologie), l’écologie et la biologie médicale : 1/ acquisition des connaissances descriptives de cette espèce rare et peu étudiée, 2/ écologie et génétique de l’unique colonie semi captive maintenue au CdP et, 3/ étude  de la distribution géographique et démographie de l’espèce


4. Etude des cycles naturels d’arbovirus : le modèle de la Fièvre de la Vallée du Rift. Ce projet a pour objectif de :


1) définir les modalités de circulation du virus en Afrique Centrale


2) de définir les relations entre les cycles selvatiques et domestiques (animaux et hommes) ;  


3) de définir si les cycles selvatiques d’Afrique Centrale peuvent jouer le rôle de réservoir des virus responsables des émergences épidémiques et épizootiques (Collaboration Unité des Maladies Virales Emergentes, MVE, CIRMF). D’autres virus, tel que le virus West Nile doivent faire l’objet d’approches similaires.


5. Arbovirus urbains : Modèles des virus de la fièvre dengue et chikungunya. Le virus de la dengue (DENV) et le virus chikungunya (CHIKV) circulent en milieu urbain au Gabon où on observe la présence de leurs  vecteurs majeurs (Aedes aegypti - espèce autochtone  - et Aedes albopictus - espèce invasive et importée au Gabon). Etude des bactéries endosymbiotiques du genre  Wolbachia et leur impact sur la transmission de CHIKV et DENV (Collaboration, Institut Pasteur de Paris et MVE).

Vue de la station d'études des gorilles et chimpanzés (lopé)

PERSPECTIVES

« Rongeurs et pathogènes» : Ecologie de la transmission des agents infectieux par les rongeurs et le rôle des perturbations environnementale comme facteur de risque des mécanismes d’émergence zoonotique.

Ce projet de recherche vise à caractériser les processus contribuant aux associations hôtes-pathogènes, en considérant l’environnement et l’histoire évolutive des espèces en interaction.


Objectif : Faire un inventaire des espèces de rongeurs présents au Gabon, et comprendre leur distribution spatiale et  leurs dynamiques spatio-temporelles.


Observatoire d’Ecologie de la Santé au Gabon : Le CIRMF est, de facto, un observatoire de la santé pour le Gabon et pour toute la sous région. C’est aussi un laboratoire de diagnostique de référence pour la plupart des épidémies en Afrique centrale. L’objectif est de mettre en place des observatoires d’écologie de la santé sur les stations du CIRMF. Il s’agit de développer des dispositifs de suivi à long terme focalisés sur l’écologie des espèces animales sauvages réservoirs, hôtes ou encore vecteurs  connus, et sur les risques de transmission dus aux changements climatiques et aux perturbations environnementales. Ces observatoires s’intégreront à terme dans les dispositifs d’épidémio-surveillance régionaux et dans le réseau international des observatoires de la santé en développement (Afrique australe, Océan Indien et Asie de Sud Est).


Plateforme d’entomologie expérimentale : Etude de la transmission des arbovirus en environnement contrôlé.

FORMATION

Accueil de doctorants, Masters II, stagiaires (2010 : F. Baldacchino, J. Chotte).

PARTENAIRES SCIENTIFIQUES

• Nationaux : CENAREST, IRET, USTM, SSA, ANPN, USS.

• Internationaux : CIRAD, CNRS, IRD, MNHN, WCS ;  Universités : Bonn (D), Paris X, Montpellier II, Lyon I ;  Institut Pasteur et réseau.